膜系统作为反渗透膜工艺的核心，其主要设备包括反渗透的膜元件、膜容器与给水泵等三大主要设备。预处理系统中的炭滤器、软化器、过滤器等容器设备与加压泵等动力设备构成了预处理系统的主设备。两个系统的辅助设备主要包括机械结构、管路阀门、监测仪表、清洗用设备、压力与流量等参数控制装置、系统启停与清洗等过程控制装置。
辅助设备不仅是连接系统前后各工艺的通路、形成完整系统的机械构架等实现系统性能的必要设备，更是提高系统性能的重要设备。高水平的机械结构设计不仅为系统的运行与维护提供了方便的条件，还将进一步体现出膜工艺高空间利用率与单元式系统结构的特点。
具有产水水质在线监测与运行工况自动控制的系统，可以完成絮凝剂与阻垢剂的定浓度投放、砂滤与炭滤的自动反冲洗、软化树脂的定运行时间或定处理水量自动再生、超滤或微滤组件的轮流清洗、预处理系统产水sdi指标与膜系统产水电导率的在线实时监测，并可以实现恒定产水流量、恒定系统回收率、定时膜系统清洗、变频调速方式的系统软启停等多项自动控制功能。
高水平的辅助系统设计可实现高水平的系统运行，保证系统产水质量，延长系统运行寿命，降低系统运行成本，提高系统运行可靠性，是实现主系统设计目标的重要保证。发达的反渗透系统中，辅助设备成本占总成本的比例普遍高于国内水平，甚至辅助设备成本超过了主设备成本。